Sim, é sempre muito útil manter as referências organizadas para consulta.
Para artigos, papers, teses e dissertações já temos este tópico:
Para manuais e guias não temos um tópico específico mas esta categoria aqui (cursos, guias e materiais de estudo). De qualquer forma, estamos sempre abertos a sugestões de melhoria e como organizar melhor as informações. Se achar que dá para melhorar algo, sinta-se à vontade para propor, levando em conta o que já temos aqui.