Dados sobre a pandemia do novo coronavírus

Esses dados já estão incorporados ao dataset do Brasil.io (como expliquei na minha postagem de ontem e acrescentei também na postagem original).

Mas obrigado por incluir o link para a fonte original dos dados.

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Pessoal, observando a lista de dados relacionados à pandemia de Covid-19 consolidados na primeira mensagem deste tópico, percebi a falta de uma peça do quebra-cabeças que é um dado fundamental: dados sobre as medidas de restrição e liberação da circulação de pessoas, funcionamento do comércio, etc., em nível de município.

Idealmente, isso poderia ser feito com uma an√°lise dos di√°rios oficiais, como o que foi iniciado pelo Lucas Cabral (mas que por enquanto tem apenas o Estado do Cear√°). Mas, como essas informa√ß√Ķes nem sempre est√£o prontamente dispon√≠veis, poderiam ser usadas tamb√©m not√≠cias na imprensa.

A ideia √© ter dados sobre a data em que foi adotada uma medida, se ela restringiu ou liberou determinado tipo de atividade econ√īmica e o munic√≠pio. Com essas informa√ß√Ķes, pesquisadores poder√£o passar a correlacionar os dados sobre as medidas de isolamento com o efeito no n√ļmero de casos confirmados e mortes pela Covid-19, dando uma indica√ß√£o se elas est√£o ou n√£o sendo eficazes e dando subs√≠dios aos gestores p√ļblicos decidirem se devem liberar ou restringir mais a atividade econ√īmica.

O que acham? Seria vi√°vel?

Abri uma issue para discutir essa possibilidade também no Github do Brasil.io, por sugestão do @turicas.

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Pessoal bom dia. Sou novo por aqui, pois gostei de ler as discuss√Ķes em torno dos dados do coronav√≠rus aqui no Brasil. Bem, estou fazendo um dashboard sobre esses dados e percebi que somente os munic√≠pios divulgam a quantidade de pessoas recuperadas, mas que este √© um dado importante para minhas an√°lises. Como voc√™s est√£o conseguindo obter esses dados?

Grato.

EDIT: Acabei de ver hoje que os dados dos pacientes recuperados est√° aparecendo.

EDIT 2: Os dados dos pacientes recuperados vem somente o total; ainda não vem por estado. O que vocês fazem pra pegar esses dados por estado?

Grato.

Ol√°, fiz um script para extrair a base de dados do Info-Gripe, que traz os casos de SRAG no Brasil desde 2009 (hospitaliza√ß√Ķes). Os dados e o c√≥digo est√£o aqui: github.com/belisards/srag_brasil/

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Olá, Kleyber! Seja bem vindo ao fórum!

Realmente, as Secretarias Estaduais de Sa√ļde, em geral, n√£o est√£o incluindo a informa√ß√£o da quantidade de recuperados. Estamos discutindo nessa issue do Brasil.io no Github que campos vamos pedir √†s secretarias que incluam, e o n√ļmero de recuperados √© uma das informa√ß√Ķes que j√° foi sugerida que pe√ßamos.

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Eu fiquei surpreso quando vi uma not√≠cia hoje cedo falando sobre o n√ļmero de pacientes recuperados de COVID19 no Brasil, mas aparentemente a fonte √© simplesmente algu√©m do governo que falou. O Worldometer, no entanto, tamb√©m tem esses dados, mas n√£o os vi dispon√≠veis em nenhum lugar. Ainda sobre isso, algu√©m conhece alguma base contendo esses dados mesmo que por pa√≠s?

A √ļnica fonte que eu encontrei que cont√©m os dados de recuperados para o Brasil foi nessa tabela do dataset da Johns Hopkins University. Segundo esses dados, o Brasil tem mais de 14 mil casos recuperados. Mas esse crescimento foi muito r√°pido em apenas 2 dias:

  • 13/4: 174
  • 14/4: 3.046
  • 15/4: 14.026

O que nos leva a desconfiar que há algo errado com esses dados. As fontes estão listadas no README.md, mas nenuma é brasileira.

@belisario, parab√©ns pela iniciativa de facilitar o re√ļso dos dados sobre hospitaliza√ß√£o por SRAG disponibilizados pela Fiocruz! :clap::clap:

Já incluí os links na primeira postagem.

Você chegou a automatizar a extração para que seja atualizada periodicamente?

Em uma das not√≠cias que eu citei, falaram dos n√ļmeros com base em pronunciamentos do Minist√©rio da Sa√ļde. Imagino que decidiram comunicar esses dados pela primeira vez essa semana e foram liberando de forma desorganizada de acordo com consolida√ß√£o. E esses dashboards, por sua vez, est√£o pegando manualmente, por pronunciamento.

O positivo, nesse caos que estamos, é que se o governo federal libera um dado muito destoante, os estados não perdem a oportunidade de mostrar os dados corretos e atacar o governo. Afinal, esses dados vem dos estados e municípios, eles são a fonte do governo federal.

A @fecampa fala sobre esse índice no recém lançado Episódio 5 do podcast Dadocracia.

Sim, talvez seja de algum pronunciamento mesmo. Mas tem pronunciamento todos os dias? Se n√£o, como ent√£o a Johns Hopkins University poderia ter obtido informa√ß√Ķes di√°rias sobre os recuperados?

Por enquanto, pelo menos, n√£o tem dados sobre recuperados no painel do Minist√©rio da Sa√ļde sobre a Covid.

Encontrei algo que talvez possa explicar o alto n√ļmero de recuperados, embora n√£o o motivo do seu crescimento ter sido t√£o r√°pido.

Esta defini√ß√£o, encontrada no boletim de Covid-19 da SES/DF divulgado hoje, pode explicar o alto n√ļmero de ‚Äúrecuperados‚ÄĚ:

Ou seja, para ser considerado ‚Äúrecuperado‚ÄĚ basta ter mais de 14 dias de in√≠cio de sintomas, n√£o estar hospitalizado e nem ter morrido. N√£o precisa ter feito novo teste, com resultado negativo, para a Covid-19. Algu√©m sabe se essa defini√ß√£o encontra amparo na OMS ou em alguma outra fonte?

Pois é! Eu achei muito estranho isso. E eu quero esses dados :rofl:

Encontrei nesse link o seguinte trecho:

How do I tick the statistical box of ‚Äėrecovered‚Äô?
If it’s been at least 10 days since you first had symptoms, and you’ve been symptom-free for 48 hours, the Ministry of Health considers you have recovered from Covid-19. This means the shortest possible time in self-isolation would be 10 days.

Nesse outro link, sobre vários países, ele diz:

What ‚Äúrecovered‚ÄĚ means differs by person, and is something researchers will be figuring out for years to come. Some patients who had mild symptoms have reported feeling fine after the disease passed, while others with more severe cases might have lasting lung damage. It could depend on a person‚Äôs age and if they had any preexisting conditions before they got the coronavirus.

J√° nesse documento da OMS, diz:

Patients are discharged after clinical recovery (afebrile >3 days, resolution of symptoms and radiologic improvement) and 2 negative PCR tests taken 24 hours apart. Upon discharge, they are asked to minimise family and social contact and to wear a mask. There are expectations of clinical trial results within a matter of weeks, which will see further opportunities for treatment.

Parece-me que o termo recuperado tem relação com o estado clínico e não com a presença ou não de vírus no trato respiratório. Seria [clinical] recovery, e não organismo livre do vírus, ainda que para ser liberado do hospital esperaria que o paciente tivesse negativo para PCR.

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Oi @herrmann não automatizei, mas hoje subi uma nova função para pegar os casos detalhados por gênero e faixa etária. Minha ideia é terminar de identificar os endpoints e fazer o raspador para pegar todos dados.

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Eu estou colhendo essa informação dos recuperados aqui: https://www.coronatracker.com/pt-br/country/brazil/

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Depois de tanto trabalho por parte de tantos indiv√≠duos e grupos, a Google decidiu liberar os dados do COVID19 Mobility Reports em um CSV global com os dados de todo o per√≠odo (de 15 de Fevereiro at√© 10 de Abril, na √ļltima release que saiu hoje).

Depois de tanto trabalho de tanta gente para extrair os dados, pré-processamentos que eu fiz para juntar os releases, etc :rofl:

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Sim, eu já tinha colocado na postagem original até o link para um repositório no Github em que o @vitorbaptista havia feito e compartilhado a raspagem desses dados. Agora que não é mais necessário raspar, vou acrescentar o link direto da fonte lá. Obrigado por compartilhar!

O Governo Federal disponibilizou em 16/04 o código-fonte do aplicativo do coronavírus no github

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O primeiro pipeline de raspagem que eu topei foi justamente o do Vitor. Escrevi no meu blog sobre, fiz uma espécie de tutorial e citei ele e um outro colega que raspou também. Posteriormente vi o Mobius do pessoal do Data Science Campus e montei um pipeline para juntar as duas releases do Google Mobility Reports, fazer um pré-processamento, etc. Tudo pronto para fazer automaticamente quando viessem as próximas releases. Daí hoje eles liberam o CSV :rofl::rofl::rofl:

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O @turicas anunciou no blog do Brasil.io, neste fim de semana, a criação de um novo painel com os dados epidemiológicos da Covid-19 no Brasil. Já o acrescentei na postagem inicial.

A Open Knowledge divulgou, em seu levantamento de transparência dos Estados em relação aos dados da Covid-19, o seu terceiro boletim: 78% dos estados ainda não divulgam taxa de ocupação de leitos.