😷 Dados sobre a pandemia do coronavírus

Fiz esse texto que traz um levantamento das bases de dados que podem ser úteis para medir subnotificação do COVID-19

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Saiu o novo boletim semanal da Open Knowledge Brasil sobre a transparência dos estados sobre a Covid-19:

Apenas 4 estados publicam quantidade de testes disponíveis

Vários estados aumentaram muito a sua pontuação porque divulgaram novos painéis de informação sobre a Covid-19 com a possibilidade de download de dados.

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Encontrei um conjunto de dados, mantido pela ACAPS, que coleta as medidas restritivas (tais como o distanciamento social) que os governos ao redor do mundo têm adotado para combater a pandemia. Inclui dados referentes ao Brasil.

Esses dados podem ser usados por pesquisadores para correlacionar as medidas de isolamento com o ritmo de avanço da pandemia nas diferentes localidades.

Já o acrescentei na postagem original.

Pessoal, gostaria de compartilhar a visualização que fiz para o estado do Amazonas utilizando os dados do brasil.io. Espero que seja útil à sociedade amazonense e outros interessados pelo Brasil. Se tivesse tempo, gostaria de fazer uma parecida para todo Brasil.

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@hermann, poderias sugerir lá no brasil.io que incluam a latitude e longitude de cada UF, assim poderemos plotar no mapa cada estado ou cada cidade de um estado específico, como é feito no site do Bing ou de vários outros?

Kleyber,

há um problema com essa sugestão, pois os estados não possuem um único ponto no mapa a ser definido por latitude e longitude, e sim uma área, cujo contorno pode ser representado por uma série de pontos que têm, cada um, latitude e longitude. Esse contorno está presente nos datasets que têm o traçado dos estados e municípios, fornecido pelo IBGE. O código do IBGE, já presente no dataset do Brasil.io, pode ser usado para fazer o cruzamento entre esses dois datasets.

De fato, os diversos mapas que já foram produzidos (ver a seção “visualizações”) já se utilizam desse identificador para fazer o cruzamento e plotar as informações em um mapa. Muitas dessas visualizações são de código aberto. Sugiro dar uma olhada no código fonte delas para ver como fazer isso.

Sobre os datasets de estados e municípios, sugiro ver esses tópicos aqui no fórum:

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@herrmann, obrigado pela resposta. Já consegui o que queria, cruzando os dados de alguns datasets, como você indicou para obter as coordenadas de cada UF. Agora de fato o ponto crítico pra mim é a informação dos recuperados por UF e geral, que não temos e é altamente importante para minhas análises, pelo menos.

Fico no aguardo de novidades quanto a esta necessidade.

Grato.

Na última quinta saiu o 5º boletim de transparência da Covid-19 da Open Knowledge Brasil:

@kleyber, no Brasil.io pretendemos coletar os dados sobre recuperados também. Segue o link para a issue no Github que criei para discutirmos isso. Se puder ajudar a fazer acontecer, agradecemos.

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@herrmann, com certeza. Vou entrar lá e ajudar no que puder.

Grande abraço,

Obrigado pessoal por disponibilizar estas diversas bases de dados!

A quem interessar, eu gosto muito iniciativa covid19dashboards que tem reunido várias contribuições de análises com o intuito de apresentar diferentes perspectivas de estudo e exibição de dados. Eu utilizei o dataset disponivel para fazer uma adaptação a nossos estados verificando como está a trajetória de casos e mortes. Está disponível em trajetória casos e mortes por estado.

A propósito, gostei da ideia do @hermann de preencher o gap com ações do Estado e outros fatos relevantes. Quero ver se consigo usar estes dados para tentar mostrar alguma causalidade.

Abs

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O Ministério da Saúde atualizou o seu painel de dados sobre a Covid-19. Agora, é possível baixar um CSV com dados agregados em nível de município.

https://covid.saude.gov.br/

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Olá pessoal,

Coletei dezenas de datasets sobre vários aspectos dos países acometidos pela pandemia, dados epidemiológicos, sociodemográficos, políticos, econômicos, de mobilidade, e montei um dataset todo bonitinho para análise da pandemia no mundo. Foi aceito para publicação na Data in Brief da Elsevier e já está disponível no Data Mendeley para quem tiver interesse.

Segue link: https://data.mendeley.com/datasets/tggrsbz3bb/

O código, dados crus e pré-processados, pipelines, enfim, tudo, pode ser encontrado no repositório do DAGsHub aqui: https://dagshub.com/mrd/DIB_COVID19_paper

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Excelente! :clap::clap::clap:
Parabéns pelo trabalho, provavelmente será muito útil na elaboração de modelos da pandemia.

Já incluí na postagem original.

Está ao vivo agora uma live com o pessoal do Brasil.io e da Open Knowledge Brasil sobre os dados da Covid-19:

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O Conselho Nacional de Secretários de Estado da Administração (CONSAD - consad.org.br.) disponibiliza uma um painel com as medidas de resposta ao COVID-19

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Um erro na contagem de óbitos nos dados do Portal da Transparência do Registro Civil significa que os cálculos já realizados até agora sobre os óbitos não diagnosticados sobre a Covid-19 terão que ser refeitos:

Na próxima terça-feira, dia 19, às 17 horas, o NIC.br promove uma live com a participação do @turicas e do @vagner.diniz, no Instagram, sobre os dados abertos da Covid-19:

https://www.instagram.com/p/CANRA0inBDp/

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Saiu o Boletim #7 da Open Knowledge Brasil sobre a Transparência da Covid-19:

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EPICOVID19

Olá, gostaria de verificar aqui se de fato o EPICOVID19 é o primeiro e infelizmente único estudo com abrangência nacional para estimar com métodos estatísticos consistentes o número real de infectados no Brasil.

Neste sentido seria também a primeira iniciativa abrangência nacional a utilizar o investimento brasileiro realizado em testes para retornar dados (estimativa de prevalência populacional entre outros) mais padronizados e confiáveis.

A amostragem espacial teve como base 133 cidades sentinela nas outras 26 unidades da federação. O estudo piloto teve foi realizado pela UFPel (Universidade Federal de Pelotas), com apoio institucional e financeiro da Serrapilheira, e neste momento tem apoio do Ministério da Saúde.


Links do estudo:

Links (amostra de centenas) de notícias recentes sobre barreiras “culturais” ao estudo:

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Portal de Dados Abertos desenvolvido pelo DataSUS:

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